桃果实PpAO基因的电子克隆及生物信息学分析
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摘要: 研究克隆桃果实中的PpAO(Prunus persica ascorbate oxidase)基因,并对其序列进行了生物信息学分析。研究采用电子克隆和RT-PCR(reverse transcription PCR)相结合的方法分离桃果实PpAO基因的cDNA全长序列,利用各种软件对序列进行生物信息学分析。实验成功获得全长1913bp的PpAO基因序列,该序列具有完整的开放阅读框(ORF,open reading frame),编码18个氨基酸的信号肽和518个氨基酸的成熟酶。对ORF进行PCR的验证结果和电子克隆的结果一致。序列分析显示该基因的氨基酸序列同大豆和葡萄具有很高的相似度,含有Cu-oxidase3,Cuoxidase,Cu-oxidase2三个同源结构域。